在安裝高效過濾器時必須注意以下一些問題：

在高效過濾器的運輸和存放過程中，需按照廠家標識的方向放置。運輸過程中應輕拿輕放，防止因劇烈振動和碰撞免造成人為的損壞。

安裝高效過濾器之前，需對潔凈室進行清掃、擦拭、凈化空調系統內部如有積塵，應再次清掃、擦拭，達到清潔要求。如在技術夾層或吊頂內安裝高效過濾器，則技術夾層或吊頂內也應進行全面清掃、擦拭。

潔凈室及凈化空調系統達到清潔要求后，凈化空調系統必須試運轉。連續運轉12小時以上，再次清掃、擦拭潔凈室后立即安裝高效過濾器。

安裝高效過濾器之前，需在安裝現場拆開包裝進行外觀檢查，內容包括濾紙、密封膠和框架有無毛刺和銹斑：有無產品合格證，技術性能是否符合設計要求。然后進行撿漏。經檢查和撿漏合格的應立即安裝。安裝時應根據各臺過濾器的阻力大小進行合理調配，對于單向流，同一風口或送風面上的各過濾器之間，每臺額定阻力和各臺平均阻力相差應小于5%。

安裝高效過濾器的框架應平整。每個高效過濾器的安裝框架平整度允許偏差不大于1毫米。而且要保持過濾器的外框上箭頭和氣流方向一致。當其垂直安裝時，濾紙折痕應垂直于地面。

高效過濾器和框架之間的密封一般采用密封墊、不干膠、負壓密封、液槽密封和雙環密封等方法時，都必須把填料表面、過濾器邊框表面和框架表面及液槽擦拭干凈。密封墊的厚度不宜超過8mm，壓縮率為百分之二十五到百分之三十五。其接頭形式和材質應符合設計要求，框架各接縫處不得有滲漏現象。采用雙環密封條時，粘貼密封時不要把環腔上的孔眼堵住；雙環密封和負壓密封都必須保持負壓管道暢通。

目前國內大多數高效過濾器的安裝都是采用密封墊法安裝的，因海綿橡膠板是閉孔型的，具有良好的氣密性，因此一般用它作為作密封材料。如有必要，最好在密封條上均勻的打上點玻璃膠。把過濾器和靜壓箱連接上時，四周受力要均勻。待24小時后，玻璃膠干了再運行凈化系統。