空氣過濾器按與外部結構的密封方式分類：固體墊密封、液槽密封和負壓泄漏密封。

固體墊密封:過濾器周邊粘貼有彈性的固體密封墊，如氯丁橡膠，閉孔海綿橡膠板等，通過受力擠壓的方式來達到接觸面之間的密封。

液槽密封：液槽密封過濾器的邊框設有一圈溝槽，溝槽內充滿非牛頓密封液。安裝時，將刀口插入溝槽中的非牛頓密封液進行密封，作用原理類似泡菜壇。此種密封方式穩定可靠，泄漏少，在凈化級別較高的潔凈室內廣泛使用。

負壓泄漏密封：嚴格的說此種密封方式不由過濾器決定，而由安裝有過濾器的設備和安裝位置決定。該種密封方法的原理是將過濾器下游端的已經過濾的空間作為正壓，未過濾的空間作為負壓，從結構設計上解決過濾器與外部結構的密封問題。FFU、隧道烘箱一般采取此類密封方式。